Nach den dramatischen Ereignissen am Ende der zweiten Staffel bleibt die Fragen offen, wie es um Miguels (Xolo Maridueña) Zustand steht. Schwer verletzt musste er ins Krankenhaus eingeliefert werden, wo die Ärzte um sein Leben kämpfen.

Sein Trainer Johnny (William Zabka) steht vor einem Scherbenhaufen, denn sein Dojo wird nun John Kreese (Martin Kove) geleitet. Um sich gegen Kreese und seine Schüler zu behaupten, müssen Johnny und Daniel LaRusso (Ralph Macchio) ihre alte Rivalität bei Seite legen und sich zusammen tun.

Doch Daniel geht noch einen Schritt weiter und reist trotz Einwänden seiner Frau Amanda (Courtney Henggeler) nach Japan, um auf den Spuren seines alten Meisters Miyagi zu wandeln.